Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFX4Q33E94 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms