Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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