Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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