Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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