Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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ITSN1Q15811 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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ITSN1Q15811 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITSN1Q15811 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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