Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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