Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18Q15532 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms