Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HTR4Q13639 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HTR4Q13639 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HTR4Q13639 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HTR4Q13639 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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HTR4Q13639 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR4Q13639 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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