Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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