Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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