Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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STX4Q12846 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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STX4Q12846 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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STX4Q12846 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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