Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms