Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms