Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms