Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms