Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREMQ03060 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms