Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms