Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OC90Q02509 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms