Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPCAP84074 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPCAP84074 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPCAP84074 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms