Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms