Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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