Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms