Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSK3BP49841 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms