Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms