Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC19A1P41440 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms