Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CD34P28906 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CD34P28906 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CD34P28906 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms