Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms