Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCP1P17987 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCP1P17987 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCP1P17987 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TCP1P17987 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms