Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms