Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TPRP12270 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPRP12270 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPRP12270 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPRP12270 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPRP12270 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TPRP12270 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TPRP12270 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TPRP12270 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms