Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms