Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms