Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms