Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PHOX2AO14813 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms