Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3QRK9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms