Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms