Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms