Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSTM2BA6NLU5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms