Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC144AA2RUR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms