Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPD8

KDM4F, Lysine demethylase 4F, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4FA0A1W2PPD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM4FA0A1W2PPD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4FA0A1W2PPD8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms