Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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