Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms