Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms