Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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