Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms