Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLEC4AQ9UMR7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLEC4AQ9UMR7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLEC4AQ9UMR7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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