Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD1Q9UIS9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms