Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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