Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FRMD4AQ9P2Q2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms