Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHPF2Q9P2E5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms